ضرورت مسئله
تشخیص سریع و ارزان آلودگیهای میکروبی در روند کنترل کیفی دارای اهمیت بالایی میباشد. استفاده از روشهای برپایه کشت باکتری یک روش سنتی دقیق ولی زمانبر است. روشهای جایگزین دیگری مانند واکنش زنجیرهای پلیمراز (PCR) که یک روش سریع و با اختصاصیت بالا است، وجود دارد. در روش PCR امکان تمایز بین میکروبهای زنده و کشتهشده وجود ندارد و علاوه بر آن احتیاج به تجهیزات گرانقیمت، نیاز به یک تکنیک جایگزین و مناسب را ایجاد کرده است. استفاده از تکنیکهای بر پایه ایمونواسید مانند الایزا نیز روشی دقیق، سریع و بدون نیاز به تجهیزات گرانقیمت میباشد؛ اما چالش موجود در این روش، تولید آنتیبادیهای اولیه و ثانویه و امکان cross-reactivity بین گونههای مختلف یک جنس میباشد. کیت پیشنهادشده از تکنیک هیبریداسیون RNA استفاده میکندکه در آن به جای استفاده از آنتیبادی اولیه برای گیرانداختن مولکول هدف از Capture Probe و برای شناسایی آن به جای استفاده از آنتیبادی ثانویه ازDetection Probe استفاده میگردد و برای مشاهدهی واکنش از سیستم آنزیم-سوبسترا و خوانش طول موج تولیدشده توسط فعالیت آنزیم بر روی ماده فلورسنت استفاده میشود. بههمین علت امکان cross-reactivity بین گونهها کاهش مییابد. میزان حساسیت این روش بسیار بالا میباشد زیرا اساس تشخیص این روش شناسایی rRNAهای موجود در سلول باکتری میباشد و از آنجاییکه هر سلول باکتری دارای یک کپی از DNA است ولی دارای هزاران کپی از rRNA میباشد حساسیت این روش بسیار افزایش یافته است؛ به گونهای که حد تشخیص این روش 1-10cfu میباشد. بنابراین میتوان بدون کشت باکتری، نمونه خام را مورد بررسی قرار داد. از آنجاییکه توالی rRNA حاوی نواحی حفاظتشدهای بین باکتریهای یک گونه میباشد، استفاده از پروب الیگونوکلوئتیدی اختصاصی برای هر گونه باکتری، میزان اختصاصیت این روش را بسیار قابل قبول کرده است. بنابراین کیت پیشنهادی با حذف محدودیتها و همزمان دارابودن نقاط مثبت روشهای قبلی و یک پیشنهاد ایدهآل برای آزمایشگاههای کنترل کیفیت خواهد بود.
مشروح مسئله تحقیقاتی
امروزه به دلیل پیشرفت تکنولوژی تشخیص میکروبی، اجرای قوانین ایمنی مواد غذایی، افزایش شیوع بیماریهای ناشی از غذا و افزایش آگاهی مصرفکنندگان، بازار جهانی تستهای تشخیص پاتوژن در موادغذایی در حال افزایش است. روشهای بر پایه کشت میکروارگانیسم قدیمیترین روش تشخیص آلودگی در صنایعغذایی میباشد. در این روش زمان رسیدن به نتایج 15-2 روز میباشد که در این بین باکتریهای با سرعت رشد بالا امکان تکثیر پیدا میکنند. از این رو تولیدکیت تشخیص سریع میکروارگانیسمهای بیماریزای موجود در مواد غذایی و آب با شرایط زیر مورد نظر میباشد:
- امکان بررسی کمی و کیفی میکروارگانیسمها (باکتری و قارچ) در مواد غذایی و آب
- امکان تشخیص گونه باکتریهای بیماریزای موجود در مواد غذایی و آب (E.coli, Salmonella, (Pseudomonas, Staphylococcus و شناسایی مخمرهای (Aspergillus, Candida) با توانایی حد تشخیص کمتر از 10 cfu
- امکان تشخیص بدون نیاز به کشت باکتریها
- امکان تشخیص سریع میکروارگانیسمها با حد تشخیص 2 ساعت
درباره شرکت متقاضی
یکی از راهبردهای این شرکت دانشبنیان، همکاری با سازمان غذا و دارو ایران بهعنوان آزمایشگاه همکار میباشد و طیف وسیعی از خدمات در زمینه آزمونهای زیست سازگاری، میکروبی، شیمی و حیوانی برای انواع محصولات سلامتمحور ارائه مینماید. یکی از وظایف این شرکت در جهت برآوردهکردن الزامات سازمان غذا و دارو، کنترل کیفی مواد اولیه و فرآوردههای سلامتمحور و کنترل محیطی میباشد.
گامهای تحقیق
- طراحی آزمایش و انجام آن در مقیاس آزمایشگاهی
- بهینهسازی و اثبات تکرارپذیری فرآیند انجام واکنش
- انجام تستهای کنترل کیفیت کیت و مقایسه آن با روشهای موجود
- ارائه تائیدیه آنالیز آزمایشگاه مورد تایید و همکار سازمان غذا و دارو برای نمونههای سنتز شده
- تهیه مستندات، تدوین و ارائه گزارش عملیاتی اجرای پروژه
خروجیهای مورد انتظار تحقیق
- تولیدکیت برپایه هیبریداسیون دو پروب الیگونوکلوئتیدی اختصاصی با RNA هدف (یک پروب جهت گیر انداختن مولکول هدف به کف پلیت و یک پروب جهت شناسایی آن با استفاده از واکنش آنزیم-سوبسترا)
- تولیدکیت تشخیصی با قابلیت بررسی کمی و کیفی میکروارگانیسمها (باکتری و قارچ) در مواد غذایی و آب
- تولیدکیت تشخیصی با قابلیت تشخیص گونه باکتریهای بیماریزا موجود در مواد غذایی و آب (E.coli, Salmonella, Pseudomonas, Staphylococcus) و شناسایی مخمرهای (Aspergillus, Candida )
- تولیدکیت تشخیص میکروارگانیسمها با حساسیت حداقل 5000 cfu.
- تولیدکیت تشخیص میکروارگانیسمها با قدرت تشخیص در مدت زمان 2 ساعت.
- تولیدکیت تشخیصی با قابلیت بررسی میکروارگانیسمها بدون نیاز به تجهیزات (به جز اسپکتروفوتومتر به منظور خوانش طول موج ماده فلورسنت)
- تولید حداقل 3 بچ آزمایشگاهی 96 تستی تکرارپذیر
- تولیدکیت با درصد خطای کمتر از 1% در مقایسه با روشهای معمول آزمایشگاه (روشهای بر پایه کشت)
- ارائه تائیدیه آنالیز صادرشده برای سه بچ آزمایشگاهی 96 تستی به نام شرکت متقاضی توسط آزمایشگاه مورد تائید و همکار سازمان غذا و دارو.
- تدوین و ارائه گزارش عملیاتی اجرای پروژه شامل فرآیندهای انجام شده (توالی پروبهای سنتز شده، نوع و میزان مواد استفاده شده، نحوه اجرای فرآیند، پارامترهای کلیدی موثر بر فرآیند، بایدها و نبایدهای اجرایی، دستورالعمل انجام واکنش و نتایج مربوط به انجام فرآیند و تفسیر آنها)
الزامات تحقیق
- تیم متخصص در زمینه طراحی و سنتز کیت تشخیص سریع میکروارگانیسمها با توانایی عیبیابی، بهینهسازی و اجرا در مقیاس آزمایشگاهی و نیمهصنعتی
- آزمایشگاه تحقیقاتی مجهز دارای تجهیزات لازم بهمنظور انجام واکنش
- دسترسی به آزمایشگاه کنترل میکروبی و شیمیایی همکار سازمان غذا و دارو جهت آنالیز و صدور برگه آنالیز نمونههای سنتزشده
گلوگاههای احتمالی
- طراحی و سنتز پروبهای الیگونوکلئوتیدی اختصاصی برای هر گونه باکتری و مخمر و نشاندارکردن پروبهای سنتزشده
- تولید پلیتهای 96 خانه کوتشده با استرپتاویدین جهت اتصال پروبهای الیگونوکلئوتیدی
- سنتز محلولهای لیزکننده سلول و تخلیص RNA سلول
- سنتز محلولهای stop solution ، Hybridization solution
زیرساختها و تجهیزاتی که متقاضی میتواند در اختیار مجری قرار دهد
- امکان انجام تستهای کنترل کیفیت محصول تولیدشده و مقایسه آن با روشهای معمول، بررسی آلودگی میکروبی جهت اندازهگیری صحت آزمایش
- در اختیار قراردادن فضای آزمایشگاهی و تجهیزات شرکت مانند دستگاههای اسپکتروفوتومتر، انکوباتور، هود لامینار، دستگاه Thermal cycler، دستگاه الکتروفورز و ژل داک
معیارهای ارزیابی و انتخاب مجری
- تیم متخصص متشکل از رشتههای بیوتکنولوژی دارای تجربه در زمینه طراحی، سنتز و نشاندار کردن پروب الیگونوکلئوتیدی
- تیم متخصص با دانش میکروبیولوژی و دارای تجربه آزمایشهای تشخیص میکروبی
- تیم متخصص ایمونولوژی و آشنا به فرآیند ساخت کیت الایزا
تسهیم مالکیت فکری
- مالکیت معنوی: مجری در مالکیت معنوی ناشی از اجرای تحقیق سهیم خواهد بود و انتشار مقاله مشترک توسط مجری و متقاضی در ژورنالهای داخلی و خارجی، ارائه مقاله در کنفرانسها و سمینارها با موافقت و اشاره به نام همه دستاندرکاران مجاز خواهد بود.
- مالکیت منافع مادی: با توجه به مدل کسبوکار شرکت متقاضی، منافع مالی ناشی از توسعه این فناوری تماماً متعلق به شرکت متقاضی بوده و مجری صرفاً حقالزحمه اجرای پروژه تحقیقاتی را دریافت خواهد کرد.
ارتباط با ما
شماره تماس:
021-88486498
اینستاگرام:
iran.challenges@